货代是负责货物的承运工作，而海关是负责货物在运输过程中的监管工作。只有符合国际和中国运输监管条件的货物，才能由货代运送进出中国的境内。
1.利益共同体
从支持国家国际贸易业务往来的角度看，货代和海关是一体的。为了促进国际业务的往来，两者必须通力合作，保证外贸业务的顺利进行。货代业务员需要将外贸公司或者工厂的出口货物所需单证整理清楚，递交给海关审核。当审核通过以后，货物才能自由进出。
货代业务员是把握货物进出口的第一关。客户那边往往对货物的进出口所需要的材料、证明等不是很清楚，这就需要货代业务员帮助客户一起把这些资料及其证明整理清楚、齐全，最后递交海关，为海关的工作节省时间。海关也需要货代业务员先行将所有资料整理清楚，来提高自身的工作效率，毕竟每天要审核成百上千的单证，这样的配合是必不可少的，所以货代和海关是利益的共同体。
2.矛盾综合体
货代业务员既要代表外贸公司或者工厂，又要代表海关对货物进行监控。相对来讲客户方是直接利润的来源，很多时候货代业务员为了客户的货物能安全及时进出口而和海关据理力争，所以货代与海关又是矛盾的综合体。其中最好的例子就是商品的归类问题，由于所处的立场不一样，导致的结果可能会相差很大。商品有时根据用途材质可以归入不一样的编码，所导致的出口税率差别有时很大。海关一般会按照有利于国家的原则进行归类，而客户那边会按照实际的用途和对自己的有利程度进行归类，这中间就会产生矛盾。
案例分析
外贸公司委托工厂出一个20GP的柜子，装的是铝制的垫圈。工厂一直是按照工业用垫圈进行归类的，但是在一次出货的过程中，被海关查验。海关工作人员打开集装箱看到物品后，认为应该按照材质归类，归入铝制钢圈。由于按照材质归类退税比按照用途归类的税点要少5%，所以海关工作人员就认为外贸公司故意骗税，扣押集装箱的出运，直接交给缉私部门的人负责。
作为货代业务员当然需要去解释，写情况说明，希望海关能够更改认定结果。但是最终的结果是交保证金，改报关商品编码重新申报。最后货物是出去了，但是整整延后了1个月。结果外贸公司多出了很多仓储费用，损失了很多退税，并且影响到国外客户的信誉；而相对于货代业务员来说，问题虽然解决了，但不仅在这票货物上有些亏损，还失去了这家外贸公司客户的信任。
分析：海关与发货人所站的立场不同，导致了最终的结果不同，但是海关的承载体是国家，个人的利益首先要服从国家的利益。站在货代业务员的角度，毕竟发货人是自己的利润来源，肯定需要帮助发货人去解释，去理论，此时和海关就是对立的。海关最终的决定，会直接导致货代损失客户。
货代业务员是海关与发货人之间沟通的桥梁，是直接面对海关的。不管是利益还是矛盾，终究只是针对某一票货物、某一家客户，问题解决后，还得去协调新的问题、新的客户，所以两者又是密不可分的。
