虽然跨境电商产业近年来发展迅速，但也获得了很大的政策支持。但跨境电子商务的全步骤必须采购工作流程、物流运输、移动支付、售后服务等重要环节的对接相互配合能够平稳发展趋势，国内的跨境电商现状依然存在好多个窘境：
1.售后服务难题
售后服务是购物中非常重要的一个环节。然而，跨境电子商务的售后问题是一个令消费者气馁的重要因素，因为在整个购物过程中有很多环节，而跨境通关和物流等任何环节的问题所导致的物流费用和权益保护成本都非常高。
2.线上支付的困境
第三方支付行业的发展并不迅速。支付宝、京东网上银行等22家第三方支付公司均获得跨境电子商务外汇支付资格。然而，即便如此，支付问题仍然面临许多困难。通关退税、境外买家支付的外币在国内不能直接兑换成人民币、资金回笼时的外汇问题等跨境业务。并且在支付信用、安全、风险等方面也是限制性因素。
3.有限的供应渠道
针对进口跨境电子商务而言，货源供应商的来源于尤为重要，方式受到限制将无法确保一手货源总数和质量。现阶段，除了天猫国际、苏宁易购等直接与海外商家联系供货的大型电子商务平台外，其他中小企业平台很难授权海外品牌。许多卖家选择个人买家或专业团队代表他们从海外零售商那里购买。在这种情况下，渠道非常不稳定，商品供应质量得不到保证，将会出现供应不足甚至假冒伪劣商品。
4.物流限制
物流是跨境电商和传统贸易发展的核心因素，现在跨境电商和跨境电商物流都是制约发展的主要瓶颈。牵制关键反映在2个层面，一要中国的货运物流公司和国际物流公司比照起來差别还较为大，假如根据装运的方法来进行跨境电商物流则又非常容易导致供应链管理破裂，最后危害货品的货运物流速率。通常，解决这一难题的方法是建立海外仓库，这伴随着另一个困境:如何提高海外仓库的周转率，降低运营成本。
