毫无疑问，税收对跨境电子商务的发展造成了一定的障碍，构成了“贸易壁垒”。一方面，税收使得卖家的成本增加，最终会将大部分税收转嫁到消费者身上，使得进口国消费者的支出增加。另一方面，复杂的纳税手续使得卖家运营成本增加，部分卖家因此退出跨境电子商务行业。
但是，从政府的角度来讲，对跨境电子商务商品征税，一方面是为了增加税收，另一方面则是为了保障传统贸易、传统经销商与网络销售商的公平竞争。从目前的趋势看，各国未来对电子商务销售征税是一个可预见的结果，因此，跨境电子商务从业者应该做好准备，以应对税收带来的各种影响。
由于大多数发展中国家电子商务发展水平不高，传统商业形式占据主体地位，基本上对于电子商务征税持观望态度，没有形成完整的税收政策。印度是第一个对电子商务征税的发展中国家，1998年印度全面修改了不利于信息经济发展的法律，制定了促进信息经济发展的法律。1999 年4月28日，印度发布了电子商务税收政策，对在境外使用计算机系统，而由印度公司向美国公司支付的款项，均视为来源于印度的特许权使用费并在印度征收预提税。2000年8月31日，新加坡发布电子商务税收原则，明确征收电子商务所得税和劳务税。印度和新加坡是少数政策立场明确的发展中国家。
发展中国家电子商务飞速发展，税收政策面临巨大挑战，大多数发展中国家的电子商务税收政策模糊，立场不明确，印度和新加坡坚持对电子商务征税，其电子商务行业并未如西方税收专家所言被抑制发展，反而迅速发展起来。
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