由于对财务账册进行检查是海关稽查的主要手段，下面将重点对这一方法开陈述。财务账册检查方法，按照检查会计资料的记账顺序的不同划分，有顺查法和逆查法；按照检查会计资料的技术内容划分，又有核对法和审阅法；按照检查会计资料的范围的大小划分，则有详查法和抽查法。
(1)顺查法和逆查法
①顺查法。顺查，是按会计记账顺序的相同方向，从会计凭证入手，逐步追查到会计账簿和会计报表。顺查法有以下特点：第一，它从经济业务发生的原始记录开始，从小处着手，由点到面；第二，它注重于账册单证的机械核对；第三，顺查法注重于通过原始凭证的审查来确定被稽查人经营活动的真实性与合法性。其缺点是不从大处着眼，不能把握稽查重点，稽查效率较低。由于会计凭证大多按时序依次编号装订保管，因此，不便于按业务类别深入系统的审查和研究各类业务，不利于稽查人员分工协作。
②逆查法。即按照会计记账顺序的相反方向，由报表人手，揭示被稽查人经营活动中的薄弱环节和反常现象，发现线索，明确重点，再据此追查到总账各账户及其所属的明细分类账，然后核对记账凭证，审查原始凭证，查清其发生的原因和事实。它能从整体上了解企业生产经营的基本情况，迅速地发现问题，把据稽查重点，提高稽查效率。同时，逆查法能按业务、科目系统地进行查账，便于稽查人员的分工负责。
(2)核对法和审阅法
①核对法。核对，包括复核和勾稽两层意思。复核是指对过去的会计记录重新进行验算、验总和验记。勾稽是指对会计的过去记录之间同一数字反映在两个或两个以上方面进行勾对，用以查明各种会计资料之间的平衡关系，以便从中发现差距，揭露出错误和舞弊，证实会计报表所反映的经营成果和财务状况的真实性。实际工作中，通常进行凭证之间、凭证与账簿之间、账簿之间和账簿与会计报表之间的核对。
②审阅法。审阅是指对会计凭证、账簿和报表以及有关资料所做的详细审查和研究，从而初步确定凭证和报表所反映的经营活动有无问题，发现可疑之处，再确定深入检查的重点和方向。
(3)详查法和抽查法
①详查法。其是指通过对被稽查人某一被稽查期内所有的会计资料进行周密而详细的审查，是掌握被稽查人经营情况真实性与合法性的一种方法。
②抽查法。其是指从被稽查单位的某一被稽查期内，选取部分的会计资料进行检查，并以此推断被稽查人部分或全部经营情况真实性与合法性的一种方法。要利用抽查方法进行稽查，稽查人员就必须认真考虑以下三个问题：抽查的项目、抽查的数量、如何根据抽查获得结论。
