第三方支付机构的最大特点就是方便快捷。以国际支付宝为例，其在线跨境交易的基本流程是：速卖通卖家在平台上开设网店，发布产品；平台的海外买家搜索到该产品时，经过与卖家磋商后，可以直接在线下订单。具体操作就是，通过“国际支付宝”这个第三方支付工具，买家付款到速卖通平台；卖家确认买家已经付款后开始发货；买家收到货物之后，确认收货；速卖通平台放款给卖家。在这一交易流程中，速卖通平台通过“国际支付宝”第三方支付服务，起到了交易的支付保障作用。它不仅减少了买卖双方因为语言沟通不畅，害怕因流程麻烦而造成的订单流失，而且在线交易能有效解决传统贸易中买家担心付款后收不到货、卖家担心发货后收不到钱的两难问题，有利于买卖双方建立信任，减少沟通成本，促成快速成单。
由于整个流程是在线上完成的，无须客户提交纸质指令到银行柜台办理，因此提高了结电子商务支付与结算算效率。与传统结算方式相比，它们不需要银行作为支付的中介，因为平台自身已经介入买卖双方关于是否及时发货、货物质量是否与描述相同等的纠纷处理，而传统的结算方式，银行作为支付中介，是完全不介入买卖双方的货物买卖合同履行项下的纠纷的。
同时，第三方机构还可以跨境贸易平台为基础，围绕客户提供出口退税、VAT缴费、供应链融资等一系列增值服务。正是由于电子化、无纸化、低门槛和低成本满足了小额、高频的交易需求，第三方支付机构越来越多地成为中小卖家跨境贸易的选择。
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