除了网上银行支付、国际信用卡支付等支付方式，还有一种方式也可以相对降低网络支付的风险，那就是正在迅猛发展的利用第三方支付机构进行支付的方式，这种第三方支付机构必须具有一定的诚信度。
在实际的操作过程中，这种第三方支付机构可以是发行信用卡的银行本身。在进行线上支付时，信用卡号及密码信息只在持卡人和银行之间转移，降低了通过商家转移而导致的风险。同样，当第三方支付机构是除银行外的具有良好信誉和技术支持能力的某个机构时，支付也可以通过第三方支付机构在持卡人或客户和银行之间进行。持卡人首先和第三方支付机构以替代银行账号的某种电子数据的形式(如邮件)传递账户信息，避免将银行信息直接透露给商家;也不必登录不同的网上银行界面;另外，其每次登录时，都能看到相对熟悉和简单的第三方支付界面。第三方支付机构与各个主要银行之间又签订有关协议，使得第三方支付机构与银行可以进行某种形式的数据交换和相关信息确认。这样，第三方支付机构就能在持卡人或消费者与各个银行及最终的收款人或商家之间建立一个支付与结算通道。
第三方支付的特点显著。第一，第三方支付机构提供一系列的应用接口程序，将多种银行卡支付方式整合到一个界面上，负责交易结算中与银行的对接，使网上购物更加快捷、便利。消费者和商家不需要在不同的银行开设不同的账户，可以帮助消费者降低网上购物的成本，帮助商家降低运营成本;同时，还可以帮助银行节省网关开发费用，并为银行带来一定的潜在利润。
第二，较之SSL、SET(安全电子交易协议)等支付协议，利用第三方支付机构进行支付操作更加简单且让人易于接受。SSL协议是应用比较广泛的安全协议，在SSL协议中只需要验证商家的身份。SET协议是基于信用卡支付系统发展得比较成熟的技术。但在SET 协议中，各方的身份都需要通过CA进行认证，程序复杂，手续繁多，速度慢且实现成本高。而选择第三方支付时，商家和消费者之间的交涉由第三方支付机构来完成，从而使网上交易变得更加简单。
第三，第三方支付机构本身依附于大型的门户网站，且以与其合作的银行的信用为信用依托，因此第三方支付机构能够较好地突破网上交易中的信用问题，有利于推动电商的快速发展。
