首先，B2C跨境电商模式的政府监管成本很高。
在这几年的试点中，各部委及地方政府新建了各种监管系统，以希望用电子化的方式完成监管。然而，跨境电商进出口的货物最终还是需要线下检查的，而B2C类跨境电商的货物(物品)都是以包裹形式存在的，这无疑大大增加了一线监管部门的工作量。对于出口还好，毕竟大部分产品都是工业品，不涉及商检的检验，也不涉及海关的征税问题。然而，对于进口，尤其是食品、化妆品、母婴用品等高风险类商品，相关部门几乎拿不出一个真正有效的监管方案。一方面，如果提高通关效率，大量包裹虽然可以快速通关，但也逃离了监管部门的检查，其在后续流通领域的潜在风险大大增加;另一方面，如果严格按批次监管，虽然可以控制风险，但面对每天如此多的包裹，一线监管部门不知道要增派多少人员才能完成工作。尽管我们看到海关、商检等部门在B2C跨境电商监管方面的创新，但最终都无法真正解决海量包裹的高监管成本问题。
其次，B2C跨境电商企业与政府监管政策的配合意愿弱。
对于进口的政策，大部分B2C跨境电商企业都是愿意配合的，毕竟配合意味着合法化、阳光化。然而，对于出口方面的政策，很多B2C企业都不愿意配合。究其原因，主要有两个:一是操作成本增加。配合出口跨境电商政策，意味着原来直接小包出去的货物都得先申报，而申报本身是一件很麻烦的事情。例如，需要将货物按照HS编码进行归类，再填报相应的品名、数量、规格等信息，对于包裹量大的企业必须安排专员来对接，显然操作成本增加了。二是税负成本增加。本来，出口跨境电商企业希望争取出口退税，但由于很多企业本身是市场采购，并没有获取增值税发票，因此最终还是无法获得退税。而如果按照一些试点地区的不征不退政策，企业的出口行为虽然阳光化了，但同时意味着企业面临20%左右的所得税税率。更重要的是，这些企业本身没有采购发票，使得收入几乎等同于利润，最终要缴纳的所得税就更多了。因此，对于B2C出口跨境电商企业,如果不是出于资本化运作的合规性要求，几乎都不会花成本配合政府的监管。近年来国家经济下行，因此，国家对于不是特别阳光化的B2C跨境出口行为，采取的是一种容忍的态度。
最后，B2C跨境电商规模占进出口贸易总额很小。
正是因为B2C跨境电商监管成本高、企业配合意愿弱、规模总额偏小，国家在2015年年底完成对跨境电商试点城市的验收后，决定将政策从B2C转换到B2B上来，鼓励跨境电商企业重点发展B2B模式
