电子商务行业税收新政策对电子商务企业的影响因企业而异。对资金充裕、品类齐全的大型跨境电商企业和经营轻奢品的企业具有积极意义。但是，这对那些依赖低价的企业产生了很大的负面影响。
一、有利企业
此类的企业一般都是代行的跨境电子商务平台，采用报税进出口模式，这样的平台一般有很多的资金，资金链不容易出现断裂，平台上的商品种类繁多，定价也多样化，商品种类结构完整，客流量很充足，国外也有不错的供应链对平台起到支持的作用，这类平台已经具有规模化优势。比如四大跨境电子商务平台之一的亚马逊，就可以通过合理的优化供应链来减少部分的税负，由于这类平台上的品牌商品很多，有良好的的信誉，也可以取得国外品牌供应商的信任，在获得通关单比较容易，进入保税区也比较顺利。
轻奢侈品保税物流电子商务平台，这类平台经营的是中高档段位的产品，价格一般是这么划分的：化妆品单价一般高于100，母婴用品保健品一般高于500，服装家纺产品一般高于250元，在这一区间的保税物流方式商品享受的税改红利最大。大多数商品都有8%-30%的折扣。
二、不利企业
依托低价电商平台，主要经营低价热门产品、日韩美妆类的产品不会过百，过去采用50元的免税门槛，减轻税负，在价格上占便宜。如今，面对10%以上的税负上涨压力，价格优势弱化，核心竞争力降低，这些都促使这类电子商务平台转变经营模式。
在文章的结尾简单说一下，我国进出口贸易税收新政传达了政府通过政策和体制改革促进跨境电子商务行业规范发展的意愿。当前，在全球化快速发展的经济环境下，全球市场对跨境网购需求巨大，跨境电子商务的进出口是经济发展到一定程度后居民海外消费需求爆炸式增长的自然产物。因此，我国跨境电子商务的发展前景依然看好。
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