企业应依照有关法律、行政法规规定，保管会计账簿、会计凭证、会计报表和其他会计资料，并将与进出口业务有关的资料(包括报关单、合同、发票、协议、运输单据、函电、许可证、批件、结汇单等)纳入会计档案管理，健全管理制度，指定专人负责妥善保存，并保证报关资料的真实性、准确性和合法性。
银行存款与现金日记账保管25年；仓库库存账，包括原材料账，产成品账，生产设备账，委托加工账，边角料、残次品账，入库单，出库单，送货单，退货单，生产通知单(制单、订单)等，保管15年；反映资金来往等情况的其他有关账册，保管15年；进出口货物所涉及的进出口报关单证、税单、往来业务函电、协议、运输单据、发票、合同等与进出口业务直接有关的资料，应当自进出口货物放行之日起，保管3年；保税货物项下的进出口报关单、手册、往来业务函电、协议、运输单据、发票、合同等相关单证，需至办结海关核销手续后，保管3年；减免税货物项下的进出口报关单、减免税批件、往来业务函电、协议、运输单据、发票、合同等业务资料，需至海关办理解除监管手续后，保管3年。
进出口企业未按照规定编制或者保管报关单证、进出口单证、合同以及与进出口业务直接有关的其他资料的，由海关责令限期改正，逾期不改正的，处1万元以上5万元以下的罚款；情节严重的，撤销其报关注册登记；对负有直接责任的主管人员和其他直接责任人员处1000元以上5000元以下的罚款。
进出口企业未按照规定设置或者编制账簿，转移、隐匿、篡改、毁弃账簿的，依照《会计法》的有关规定追究法律责任。
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