很多跨境电商企业会同时经营多家店铺，甚至在不同的平台开设不同的店铺。为了使这些店铺更好地运转，企业需要对店铺进行有效的管理。跨境电商管理的主要内容一般包含商品管理、采购管理订单管理、库存管理、分销管理、物流管理、售后管理和财务管理等工作。
1.单店铺管理的目标与工作内容
单店铺管理的目标与工作内容主要是实现订单快速处理，高效发货，实现灵活的发货模式;精准统计实时库存数据，及时安排补货，避免商品缺货，建立完善的退换货流程，有效提升退换货效率，提高店铺好评率:对账快捷准确，与供应商、往来客户的对账快速、准确，账目清晰可查。
2.多店铺管理的目标与工作内容
多店铺管理的目标与工作内容主要是店铺订单高效处理，派单、分配仓库、物流匹配有效处理，提升订单处理效率;发货效率有效提升，审单一打单一验货一称重一发货，多人协作参与;库存数据实时更新，精准统计，建立有效的库存预警制度，及时安排补货，避免商品缺货，有效防止超卖;完善退换货流程，多店铺统一退换货流程，有效提升退换货效率，提高店铺好评度，多店铺账目清晰，对账快捷准确，与供应商、往来客户的对账快速、准确，每笔账期都清晰可查;多店铺经营利润统一核算，店铺日常运营数据分析、多店铺利润准确核算，掌握公司盈亏状况。
3.跨境电商管理工具
现代管理理论认为，管理是在社会组织中，以人为核心，为实现预定目标而进行的协调活动。具体来说，管理的目的是实现组织目标，本质是协调，而中心是人。组织内部的分工与合作是管理的前提。跨境电商的店铺管理也是如此，就是如何组织人员，如何实现团队协作，提高人员的配合度。由于跨境电商店铺管理的工作比较细，也比较杂，店铺在业绩持续增长时可以借助一些 ERP 管理软件。现在的ERP 管理软件基本是通过网络提供软件服务(SaaS)，电商平台和ERP 管理软件可以实现订单同步推送、商品与库存实时同步、完成发货订单回传，还能全面提高仓储管理能力合理地利用管理工具，更好地规划和设计产品内容。店铺可以根据自身的情况和发货效率，减少差错。选择工具，如有能力的大型卖家可以借鉴开发平台来管理店铺，因为使用 ERP工具，店铺的后台数据情况将无法得知。
