何行业的商家，在生产经营过程中都会遇到各种各样的风险，跨境微电商也不例外。而纵观跨境微电商的整个生产经营过程，以下三种风险是跨境微电商最容易遇到的。
1. 经营风险
这一点主要是针对那些在专业的跨境微电商平台上的微电商而言的。目前，全球跨境微电商都处于发展的起步阶段，所以这些平台往往会采用免费的模式来吸引众多跨境微电商在自己的平台上开店卖货。
有些跨境微电商觉得既然是免费开店卖货，那么就可以随心所欲地在平台上卖自己想卖的各种品类的产品。其实，不管跨境微电商是有意还是无意，一旦触犯了平台制定的经营规则，就会被平台拉入黑名单，从平台上移出。如此一来，跨境微电商就无法继续在平台上进行经营了。
2. 商标风险
跨境微电商行业之所以能在短时间内发展到如此大的规模，就是因为它有着非常庞大的消费者群体，跨境微电商能帮助境内消费者快速、高效地购买到境外的正品、真货。而跨境微电商为了满足消费者的需求，会尽一切可能地向消费者提供各种境外产品。殊不知，这种做法也会存在商标风险。
众所周知，商标具有地域性。例如，在美国的一件服装产品注册了某一商标，受到美国产品商标法的保护，而如果这件服装产品出口到了中国，因未在中国注册商标，故它的商标井不会受到保护。国际上有这样的惯例，国际驰名商标因众所周知，故在其他国家往往会受到一定程度的保护，如可口可乐、麦当劳等，但那些不驰名的商标并不会受到法律保护。
我国《商标法》第十三条第二款规定：“就相同或者类似商品申请注册的商标是复制、摹仿或者翻译他人未在中国注册的驰名商标，容易导致混淆的，不予注册并禁止使用。”
例如美国的蒙纳尔服饰，它并非驰名商标，而我国的一家服装生产商已经在国内注册了蒙纳尔服饰这个品牌。当跨境微电商在国内销售美国版的蒙纳尔服饰时，对我国的蒙纳尔服饰就构成了侵权，触犯了商标法，此时，跨境微电商就需要承担相应的法律责任。所以，当跨境微电商从境外进口商品在国内销售时，往往会遭遇商标风险。
3. 假货风险
跨境微电商最怕的就是销售假货，但是，假货风险也不是跨境微电商想避免就可以避免的。
对于利润的疯狂追求，造就了某些不法分子不惜铤而走险也要制假贩假。例如，韩国的一个知名品牌气垫 BB霜，专柜正品价格是358元，而如果批发500个仿品，每个只要30元，但这些仿品在某个跨境微电商平台上却可以卖 150元，可以说是暴利。
有些跨境微电商通过海外代购的方式向国内消费者销售境外产品，在销售产品时也会验证相关证明，往往觉得证明不存在任何问题，那么这产品就一定是正品。但有时候证明是伪造的。一旦跨境微电商拿到的是假货又没有认出来，并将其销售给消费者，被消费者识别出来是假货后，不仅会遭到消费者的退货和投诉，永远失去了一个消费者，还会被自己所在的平台处理，甚至受到法律的惩罚。
