非洲跨境电商的蓝海，但是要面临的问题更多：
1.不信任与欺诈行为。
由于担心自己被骗，非洲的富人们无法在线购买高价商品，同时，他们也不愿在网上填写个人金融信息。与印度的电商市场类似，大部分非洲的电商都选择货到付款，而且一些非洲电子商务公司也采用这种方法来解决买卖双方之间的不信任。然而，货到付款会给卖家带来许多问题，如货物途中被偷窃、成本增加等因素，都会导致电商交易失败。
2.宽带费用。
移动互联网的宽带成本在非洲是很高的，部分原因是非洲仍然是一个新兴市场，然而，部分原因是，随着竞争的加剧，价格将趋于下降，但由于非洲市场的性质，非洲电子创业企业仍然需要面对相对较高的宽带成本。
同时，政治风险和不稳定也会转化成经济风险，这就意味着创业公司必须收取更高的费用才能应对高风险的投资。另外，相对于线上的网络，移动互联网网络本身的成本更高。
光缆失窃也是另一大风险，仅南非一国每年因光缆失窃而损失高达5亿美元。在这样的环境中，因特网初创公司必须依赖价格更高的无线网络传输，最终他们还是将成本转嫁给了消费者。
3.快件配送。
很多非洲国家的邮局要么瘫痪要么半瘫痪。实际上，分发问题不仅出现在非洲。许多国家(包括中国)的快递员会用摩托车/电动汽车来运送“最后一公里”的货物，但是这样做不仅昂贵而且效率低下。若邮包要寄几百英里，难度就更大了。
4.恶意竞争。
电子商务公司肯定会产生交易记录，并需要进入银行系统，这就意味着它必须缴税。如果经济是以现金为基础的，不正规的经济体系中，可能会有竞争者通过其他方式而无需缴税，然后就可以在市场上获得更多的竞争优势。
5.落后的基础设施。
基础设施仍然是非洲发展的主要瓶颈。在过去的10年里，非洲的运输基础设施和能源供应质量分别下降了6%和3%。基础设施不完善，物流供应链难以构建，限制了电商的发展，这也直接导致了物流服务基础差，货物运输时效性差。
6.教育水平低下。
多数非洲国家教育十分落后，国民教育水平较低，许多民众文化水平低下，如尼日利亚青年文化水平不到20%，即尼日利亚约80%的绝对文盲(ABCD都不知道的部分)，教育程度低也在一定程度上增加了电商的运营成本和人工培训成本。
