跨境电子商务通常是直接针对C端进行全流程设计，与传统贸易的B2B相比，其整个贸易链末端的目的国进口清关、派送等环节，均没有可以直接套用的管控模式。从目前主流的跨境电子商务交易方式来看，多数第三方跨境电子商务平台会将物流运输作为衡量电子商务信用的重要指标。

可即便如此，跨境运输过程中商品的破损、错寄、漏寄、丢件等问题仍层出不穷。尤其是圣诞节、万圣节、“黑色星期五”“双11”等促销力度极大的节假日，第三方跨境物流难以应对货物量激增的情形。另外，目的国的政治、社会、自然、基础设施环境等因素对跨境物流的影响颇深。例如，德国、巴西、澳大利亚、阿根廷等国家的海关都有过罢工运动，从而使跨境包裹遭延误，直接影响了后续物流配送效率。

通关与商检安全问题主要集中在货物通关限制、禁止进出口商品目录、商品歧视、本土保护主义、通关与商检效率及费用、关税、腐败、灰色通关等方面。一是部分卖家对于进口国的监管条件了解较少，一些禁止进口或者有条件进口的货物，没有提前了解，导致海关查验和扣货事件高发。二是税务问题混乱，长期以来的“双清包税”做法，使得本应该成为纳税责任人的卖家，长期依赖物流服务商解决税务问题，对相关税费的核算不甚精通。

无论是前者还是后者，都使得清关成为物流服务商面临的问题。而最大的变数，却是在于进口国的政策变化。当一个国家的进口政策发生变化，尤其是政策收紧的时候，对于跨境电子商务有关各方而言，往往就意味着风险增大。


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