关务筹划可以在两个层面上进行：一是在现有法律和政策的框架下，利用税收优惠政策、配合相关监管制度，以达到减轻税负的目的；二是在企业目前既有的组织结构和经营条件下，加强内部控制，规范进出口经营行为，配合海关监督管理，通过提高企业分类级别、享受便捷通关待遇等手段，实现降低通关成本、减轻税负、提高盈利水平的目标。
概而言之，就是减轻税收负担、提高通关效率、争取税后利润。为实现关务筹划的基本目标，可以将关务筹划的目标细化，具体如下。
1.履行纳税义务
履行纳税义务是关务筹划的基础目标或最低目标，旨在规避纳税风险，规避任何法定纳税义务之外的纳税成本的发生。为此，进出口商应做到纳税遵从，即依法纳税，实现涉税零风险。因为税收具有强制性，如果偏离了纳税遵从，企业将面临涉税风险。税制又具有复杂性、频变性，这就意味着纳税义务不能自动行，进出口商必须不断学习，及时、正确掌握现行《海关法》及相关法律法规，并随之进行相应的筹划，才能履行纳税义务。
2.通关成本最低化
通关成本最低化与履行纳税义务都是基本的税务筹划目标。进出口商为履行进出口义务，必然会发生相应的通关成本。通关成本包括直接通关成本和间接通关成本。前者是进出口商为履行进出口义务而付出的人力、物力和财力，后者是进出口商在履行进出口义务过程中所承受的商业风险、信誉损失、心理压力等。直接通关成本容易确认和计量，间接通关成本则需要估算或测算。海关监管通关效率越高，进出口商所承担的货物交期的风险就越小；海关监管越透明、越公正，进出口商对海关的恐惧感便越小。通关成本的降低，除与进出口商不断提高纳税能力、增强通关成本意识等主观因素有关外，还与税制、监管人员素质、监管手段、监管方式等有直接关系。同时，进出口商通关成本的降低，也意味着海关通关效率的提高、税收的增加及监管成本的降低，是一种双赢结果。
3.税收负担最低化
税收负担最低化是关务筹划的最高目标。它是一种积极的关务筹划目标。现代关务筹划应该服从、服务于现代企业的财务目标，从这个角度上说，税收负担最低化不是目的而是手段。关于企业财务目标，目前主要有企业利润最大化、企业价值最大化、每股赢利最大化、股东财富最大化、相关者利益最大化等。企业财务目标之所以有多种表述，是因为企业在不同发展阶段的侧重点不同，或企业的组织形式不同，或所站的角度不同。从关务筹划的角度看，税收负担最低化是实现税后的利润(财富、价值)最大化的基础和前提。
经济全球化导致国际经济贸易日趋频繁，进出口企业越来越多、规模越来越大，但海关税制、监管制度、通关模式具有复杂性、差异性和频变性，企业在进出口经营中如何实现税负最低、利润(价值)最大化，是一项复杂的系统工程，需要对企业关务事项进行总体运筹和安排，在法律规定、国际惯例、道德规范和经营管理需要之间寻求平衡，做到在涉税零风险下的企业利润(价值)最大化。因此，关务筹划不能只考虑个别税负缴纳得多与少，不能单纯以眼前税负的高低作为判断标准，而是以企业整体和长远利益作为判断标准，在不同的监管制度中、税收模式下、通关待遇里寻求平衡。
关务筹划的具体目标不是截然分开的，不同企业可以有不同的具体目标，同一企业在同一时期可能有几种具体目标，其不同时期的具体目标也可能有所不同、有所侧重。
