获取数据之后，就会进入数据处理的阶段。跨境电商数据处理阶段也可以称作数据准备阶段，包含从原始数据到形成最终数据集的所有操作，包括数据清洗和转换、语义层定义以及数据集定义。数据整理是大数据分析的前提条件，在对数据源进行清洗和转换等处理后可获得目标源，并对其进行分析。
数据处理有广义和狭义两种概念。广义的数据处理是指，所有的数据采集、存储、加工分析、挖掘和展示等工作;而狭义的数据处理仅仅包括从存储的数据中提取、筛选有用数据对有用数据进行加工是为数据分析、数据挖掘模型的建立所做的数据准备工作。
一般来说，跨境电商数据处理是狭义的，即对跨境电商数据进行增加、删除、改动、查询等操作。在目前大数据的背景下，数据处理工作往往通过技术手段来实现，如利用数据仓库的处理能力，对数据进行增加、删除、改动、查询等处理。在实践中，数据处理最主要的工作是对数据进行清洗，即对“脏数据”进行清洗，让数据更加规范，让数据的结构更加合理，让数据的含义更加明确，并让数据在数学模型中处于可用状态。
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