入库含收货和上架，WMS支持PO或ASN或盲收方式，但为了账务清晰，海外仓通常要求按预告收货。理论上，收货要做到“来货质控”IQC(Incoming Quality Contro1)核单、清点、质检，第三方海外仓通常不对质检负责，或作为增值服务。
收货，可按托/按箱收，或部分收、交叉转运、整理堆码后再上架。上架即货物入储位，可按特定逻辑，区域随机、补充原库位、围绕其附近上架、定义上架顺序等，多货主条件下多采用随机上架。退货的入库，处理客户不良产品，先入退货区，质检、加工包装后再入储位。
对于代发FBA头程或转仓，可借助 WMS 的越库功能Cross-docking，避免不必要的入库程序，将货物直接转至发货处。上架后即形成可销售的库存。入库环节看似容易，如果签约了很多大货物、慢销品、季节品的客户，又对新货的到货时间、数量不了解，稍有不慎就要爆仓。
无法上架，同时大小货混合操作效率是极其低下的，目前很多海外仓巨头都已刻意控制货物分类。另外，还有上轻下重、中间常用、不得阻塞通道及消防等规范稍有忽视可能影响其他环节效率，大型仓库甚至要对月台堆场进行管理。
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