直邮进口和保税进口的区别主要体现在下单顺序、清关方式、配送时效、适用商和条件以及商品售后等方面。
(一)下单顺序
直邮进口是收到订单后，从海外直接快递发货、清关、入境的消费形式，速度相对要慢一些，费用可能也会更高，但是商品的种类会比较多，很多国外的商品都可以买到。保税进口是将产品先从海外大批量运至保税区存放，当购买发生时及时清关发货，到货速度快。因为保税仓是需要提前备货的，所以商品的种类可能比较少。
(二)清关方式
我国自2016年4月8日起实施跨境电子商务零售进口税收新政策，在新政策实施前后，直邮进口与保税进口两种进口模式的清关方式都不同。税收新政实施之前，两种模式均按行邮税缴纳，在流程上，直邮模式在入境时即需清关，非全部报关，海关对其进行抽查;保税模式是先入境，下单后才清关，必须报关。
实行税收新政策之后， 保税进口商品由原来征收行邮税改为征收关税、进口环节增值税和消费税“三税合一” 的综合税。其中，关税税率暂设为零，进口环节增值税、消费税取消免征税额，暂按法定应纳税额的70%征收。
(三)配送时效
从物流配送时效方面比较，保税进口模式的配送时效快于直邮进口模式。保税进口模式提前在保税仓备货，由保税仓发货，配送时效最快，但需承担由于商品积压导致商品过期的销毁成本;直邮模式由海外供应商直接发货，配送速度较慢，且前期需要承担较多海外仓建设成本。
(四)适用商品和条件
从适用商品方面比较，保税进口模式需要提前从海外批量进口，存放在保税区内，适用于标准化商品、受到市场检验认可的热款商品以及大众化商品，主要集中于母婴类、化妆品类和食品类商品;而直邮进口模式因为是先有订单，商家和生产国当地厂商与经销商等正规渠道合作得到货源，可供选择的品类多，适用于非标和处于测试阶段的新品。
从适用条件方面比较:保税进口模式适合大平台，因为资金流动大，租仓、囤货、人员成本都是不小的开销;而直邮进口模式不用囤货，适合资金周转压力较低的情况，只是发货清关时间较长。
(五)商品售后
在保税进口模式下，退货商品无法缴纳行邮税，不能进行二次销售，是无法退回保税仓的，只能是自建退货仓存放退货商品，增加了企业的经营成本。但换货非常方便，只需发至国内保税仓更换即可，普通快递费用也较低。
直邮进口模式下的退换货就要麻烦一些，需要承担较高的国际物流配送、时效、清关等成本。以直邮中国的英国亚马逊商品为例，亚马逊自营的商品退换货相对比较便利，退货费用为4英镑;但如果是第三方供货商的商品，则需要更长的时间和更高的费用。而且国外的网站通常客服人员都很少，联系客服后还需要填写英文的退换货申请,退换货速度较慢，动辄一两个月，此外退换货的快递费用通常为国内快递费的5~10 倍。
