“四八新政”对处于免征税额内的单价为500元以下的商品的影响最大，增加相关税负后，这些商品的购物成本上升。对于一般贸易进口商来说，其缴纳的绝大部分进口增值税通过抵扣实现了税负转嫁。“四八新政”明确了个人作为纳税义务人，而又规定了电子商务企业、平台或者物流企业可以代扣代缴相关税费。“四八新政”在短时间内对跨境电商造成了一定影响，主要会使跨境电商在价格方面丧失部分吸引力，降低其与传统货物贸易的竞争力，但对跨境电商的中长期发展是绝对利好的。这次税改明确了跨境电商的贸易属性，引导该行业进入规模化、规范化的发展轨道。
另外,“四八新政”的实施，使得之前整体低税负水平的行邮税变成了税负水平较高的跨境电商综合税，增加了国家税收。另外，取消500元免征额也在很大程度上控制了原先的税收漏洞，使传统贸易方式与跨境电商方式之间、境内商品和境外商品之间的税负水平处于同一起跑线上，更显公平性。另外,“四八新政”取消了在试点城市的税收优惠，改为在全国范围内试用。这一举措策使国内各城市又趋于回归同一起点。
“四八新政”实施所引发的部分进境货物成本上涨，对大型跨境电商企业的总体影响不大，但对中小型跨境电商企业的影响较大，可能致使它们退出市场。“四八新政”出台后，它们要经过一个整合期。过去行邮税时代已经过去，跨境电商将进入另一个税制改革的发展轨道。
按照调整后的计税方式，不同产品税率有升有降。
例如，一款税前价格为120元的纸尿裤，如果按行邮税征收税费，符合500元内免税规定，故实际税费为0;如果按照跨境电商综合税征收税费，税费是14.28元(120x11.9%)，即税改后贵了14.28元。而低单价的进口化妆品及轻奢服饰等商品还将承担更高的税费。
一款税前价格为99元的化妆水，如果按照行邮税征收税费,(99x50%),符合500元内免税规定，故实际税费为0;如果按跨境电商综合税征收税费，税费是32.57元(99x32.9%)，即税改后贵了32.57元。但是，一款税前价格为200元的化妆水，如果按照行邮税征收税费，税费是100元(200x50%);如果按照跨境电商综合税征收税费,税费是65.8元(200x32.9%),税改后反而便宜了34.2元。
若个人单次购买跨境商品的价格超过限额5000元，均按照一般贸易方式全额征税。例如，以一款15000元的经典手包为例，按照之前的政策，其需要缴纳的行邮税为1500元(15000x10%);“四八新政”实施后则和普通过关商品相同，需缴纳的增值税为2881.5元[15 000x(1+13%)x17%]，税负增加。
