仓库成本高
虽然物流成本是通过错峰发货来降低的，但是由于货物到达海外仓库，所以需要按天计算仓储费用。
库存压力大
一旦选品时的市场信息把握出差错，就会导致货物销售不畅、销售不良、大量货物挤入仓库，不仅无法实现利润上涨，而且增加了仓储成本，货物海外难以处理，两个困难。
资金周转不便
批量备货至海外仓，备货的资金，物流的资金、仓储的资金等大批量的资金投入，资金回流周期长，导致卖家资金周转不便容易造成资金链断层。
海外可控性差
海外仓库受当地政策、社会因素、风土人情、自然因素等无法控制的因素的影响很大。例如，货物进口时被查扣，货物在当地仓库被查扣、没收等，对卖家的影响是巨大的。
受海外仓服务商运营能力影响大
海外仓库经营者的某些环节出现问题，货物运送可能会延误、仓库被检查、货物被没收，无论发生什么情况，给卖方造成的损失都是不可挽回的。
对卖方的选择要求更严格
使用海外仓库出货的产品，保证质量，并且需要符合当地买家的需求，商品种类繁多的公司，在海外仓囤多少SKU的货成为难题，如果选品不当会造成利润损失。
卖方仓库数据监测要求高
卖方需要实时监视商品的取出和货架的详细数据。否则，货物可能会丢失或货物的数据不合适。有亚马逊卖家反应，FBA备货数量与实际货物上架销售数量对不上，出现货物丢失的情况。在仓管、配送有完整体系的亚马逊都会出现这种情况，第三方海外仓就可想而知了。
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