跨境电商物流系统应具备支持跨境交易的物流服务的相关功能。这些功能要素主要包括:
(一)订单管理子系统
能够与主流跨境电商平台、自建站平台连接，支持线下订单导人和创建等功能;在系统智能化方面，能实现自动分仓、自动审单、标记发货及监控、发货超时提醒;能提供多种订单状态，满足客户日常处理订单的所有需求，无缝对接仓配系统，一键智能发货;能支持设置买家黑名单、试算订单利润，提前规避卖家损失。
(二)客户服务管理子系统
支持与eBay、Amazon、速卖通、Wish 等平台的消息和邮件的提取和发送;能针对不同场景设置自动发信功能;能支持取消订单申请、退换货、纠纷处理等售后服务;能支持客户数据维护和营销;能支持客户服务任务分派及任务完成统计。
(三)产品管理子系统
具有完善的产品资料库，能自定义开发流程;能支持产品资料导人和导出、自定义产品属性、批量更新产品属性;能连接刊登系统，支持产品资料推送到刊登系统。
(四)采购管理子系统
能支持智能的采购补货逻辑，保证不缺货、不断货;具有适配度高的采购模式，能支持亚马逊、eBay、速卖通等多种不同场景;支持采购、主管、仓库、财务多个角色参与，确保采购的及时和准确;具有采购异常实时统计，方便考核筛选优质的供应商。
(五)入库管理子系统
具有完善的收货、质检、上架流程，能支持先质检、后收货;支持收货后直接上架;记录整个收货、质检、架详情;仓库可以通过订单号、物流单号直接退件入库。
(六)仓库管理子系统
支持SKU维度和仓库维度查询库存;具有服务商库存快照对比，直接同步服务商仓库库存;支持仓库之间的库存调拨。
(七)出库管理子系统
具有多样化出货类型，能高效分拣出货;能处理出货异常、交接班记录，异常处理跟进到位;支持次品上架，支持产品借用归还，支持批量出库。
(八)头程管理子系统
支持头程管理流程的个性化配置;具有FBA备货计划，支持提前备货;支持海外仓头程管理流程，支持FBA仓和其他第三方海外仓管理;能够把海外仓产品直接同步到海外仓，不需要重复维护 SKU。
(九)协同子系统
能够支持移动办公，具有每日推送任务通知的功能，能随时处理待办事项，随时查看员工任务进度。
(十)数据管理系统
解决原报表冗余、表述不清、汇率耗损、数据不准确的问题，能够自定义报表，实现多维度分析、图表结合、指标监测，提供一体化数据平台，高效建立企业数据体系，能够精准分析运营成本，提前发现企业经营风险。
(十一)产品列表子系统
能够快速高效实现产品搬家，让SKU在最佳时间出现到目标客户面前，增加曝光，实现销售提升，能将图片存储在国外服务器，自动上传到Amazon、 eBay、Aliexpress等平台，能批量调整价格、数量、标题、运输方式等。
另外，跨境电商物流系统还应具备基本物流系统的功能，包括包装，流通加工，商品检验检疫、通关、装卸、搬运、物流信息等。
