由于跨境电商涉及全球的国家与地区达到200多个,这些国家与地区的法律法规、文化、经济等存在差异，因此会导致这些国家与地区的消费者在首选支付方式上存在很大的不同。到底如何为国外消费者提供更加便捷有效的支付方式，成为跨境电商行业发展的一大难题。国内跨境电商企业要考虑跨境资金的安全问题，还要照顾到跨境用户的网购体验。
这一系列的问题都给跨境支付体系带来了巨大的考验。当下全球流通范围最为广泛的在线支付工具是PayPal,它在190多个国家内流通,在跨境网购领域拥有90%以上的买家与85%以上的卖家用户群，国内的跨境电商企业可以以PayPal 作为支付平台，大力开展全球跨境电商业务。但是，由于PayPal存在提现周期时间比较长、手续费用比较昂贵等弊端，用户还要承受汇率波动可能带来的损失。
因此，跨境电商企业有必要为消费者提供除了PayPal 以外的更为多样化的支付工具，这不但能够提升消费者的购买体验，还能够降低跨境电商潜在的收款风险。
跨境电商虽然发展迅猛，但与之配套的跨境支付市场还显得一片萧条，由于其中存在巨额利润，所以许多第三方支付机构开始向跨境电商平台提供收款服务。比如，提出国际收汇解决方案的快钱支付能支持VISA、American Express. JCB等国际卡支付，贝付支付“易八通”有“跨境信用卡支付”、“跨境银行卡支付”两项服务可使用人民币进行结算，从而降低汇率风险。
2013年5月，义乌宣布开始推出个人跨境贸易人民币结算试点，其重要意义在于跨境电商企业可以无额度限制地使用人民币结算。这一举措将会给跨境支付环节带来巨大的变革，引导着跨境支付业务走向成熟，极大地为跨境电商的发展扫清了障碍。
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