取消免征税额降低重大税收风险。跨境电商零售企业擅长利用互联网信息技术，可提前确定商品编号、原产地、税率等征税参数后，核定完税价格，计核商品应缴税费；当存在免征税额时，可调节销售价格改变完税价格，实现商品应缴税额在免征税额以内，在通关时不需要缴纳税费，存在故意偷漏税费的风险。
跨境电商零售交易货值小，单票涉及税费金额较小，但面向全球企业和消费者，产生海量交易，如果存在高比例应缴税额在免征税额以内不需要缴纳税费的通关商品，日积月累，存在漏缴巨额税费的重大税收风险，对国家税收产生日益严重的损失。
为了验核商品价格真实可靠，确保税费应收尽收，监管部门会加强对商品价格审核调查，要在商品通关时验核更多信息和资料，事后对企业开展全面稽查，会影响商品顺利快速通关和企业日常经营，不利于业态稳定快速发展。取消免征税额，对全部商品律全额征税，有助于降低重大税收风险，维持稳定监管环境，促进跨境电商零售新业态合法发展。
取消免征税额降低行业造假风险。跨境电商零售企业面临激烈的行业竞争，为了吸引更多消费者，抢占更大市场，会竭力降低消费者交易成本，包括降低进口税费至零金额。为了将商品应缴税额控制在免征税额以内，企业可能故意降低商品价格，伪报原产地和商品编号以图降低税率，瞒报、少报运费、保险费、杂费，形成更大范围的数据造假。
个别企业长期故意造假降低交易成本，会吸引更多消费者购买商品，影响销售相同商品的其他企业的市场份额，危及其他企业生存发展，可能导致其他企业模仿采取类似造假手段抢夺市场份额，形成更为严重的行业造假。
为了避免行业造假影响进出口秩序，监管部门可能采取严格监管和严厉处罚的措施，对行业进行纠错整顿，对危害严重的企业进行严惩，不利于行业长期发展壮大。取消免征税额，对所有企业都一律全额征税，有助于降低企业跟风造假风险，稳定公平竞争环境，促进跨境电商零售新业态健康发展。
