垂直型跨境电商企业与传统的内贸垂直电商企业在下列几个方面有所不同：
1.采购端
垂直型跨境电商的采购模式一般根据消费者订单信息决定采购品种并向供货商进行采购。采取这样的采购模式既能减少被中间商盘剥利润，提高盈利，又可以保证产品质量，从而增强客户黏性。这也是目前我国垂直型跨境电商企业能够保持进销差价优势的重要原因。
2.支付端
由于垂直型跨境电商企业的业务重心在于发掘行业内产品与服务价值和质量，所以其在支付端往往采用与第三方合作的模式，而非自建支付体系，如兰亭集势与环球易购等。虽然跨境支付与内贸支付有所不同，但这并不是垂直型跨境电商与国内电商的重要差异。
3.物流端
物流是垂直型跨境电商与国内电商的重要差异点。考虑到跨境物流这一棘手问题，目前，海外仓已经取代大小包邮，成为解决这一问题的有效措施。例如，兰亭集势等大型垂直型跨境电商企业纷纷开展海外仓的建设，通过提前备货、集中化运输降低物流环节的成本。考虑到垂直型跨境电商企业的产品多集中于某一领域，管理成本更低，因此未来海外仓有望成为垂直型跨境电商的外贸标配。
4.关税与商检
目前，我国海关通关商检政策允许试点城市对跨境零售电商使用行邮清关规则，从制度上维持跨境电商渠道与一般进口渠道间价差，因此跨境电商产品仍具备价格竞争优势。随着未来政策的进一步完善，跨境电商企业报关程序将进一步简化，这在提高通关效率的同时也有助于降低企业交易费用。
垂直型跨境电商企业凭借其在某种产品与服务上极强的专业性、价格的合理性，较综合型跨境电商企业具备一定的竞争优势，是一种具有“刚性”的电商企业模式。
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