对于跨境电子商务商家来说，跨境关税是一定要重视的问题。为了公司长远的未来做准备，实现跨境电商B2B和B2C卖家需要了解跨境电商整个过程中的税务问题，从而实现运营的法制化和正式化。
与国内电子商务相比，跨境电子商务要复杂得多，而且涉及两个国家的税收问题也更加复杂。包括中国境内出口货物的报关单和从目的国进口货物的清关。经报关出口后，购销合同等文件可以证明货物与外贸企业出口的货物相符，可以办理出口退税。在目的国清关进口时需要缴纳进口税，在销售阶段可能需要协助政府收取消费增值税。
目前，各国转运企业主要有三种运输方式：电子商务通关、邮政通关和邮政通关。
电子商务通关模式：大部分商品税率为11.9%，少数奢侈品、高端化妆品、手表税率为26.37%。没有免税限制，每一笔订单都要征收。关税计算公式为(商品价值+国际运费)×税率。
通关方式：以个人物品形式报关。税率分为三个等级：15%，30%和60%。具体计算公式为完税价格(或申报价格)乘以航运税率。海关总署网站公布了完税价格和税率。
邮政清关模式：运输公司从海外邮局直接向海外网上购物商品发送到运输的一种方式，国内货运价格相对较高，但由于万国邮联协议，成员寄给个人物品在海关的抽样检验，抽样率在海关不同，根据平均约为10%。电子商务通关模式的优势是税率低，通关速度快，运费成本低。适用于大、重、低值货物的运输。
邮寄清关方式最适合运输单价高、体积小、重量小的电子产品，由于清关抽样，被选中的概率非常低，免税提货的概率非常高。虽然运费贵，但绝对值得。
在选择运输方式时，我们应该综合比较价格，初步估计各种方式的收货价格。另外，我们必须仔细阅读运输公司的服务条款和禁运清单，避免货物出不去仓库的情况。
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