跨境电子商务不仅包括向国内消费者销售产品的国外平台，还有大量国内平台向世界出口中国制造的产品。在国家“走出去”政策的支持下，跨境电商将带领我们与世界人民共享高品质、低成本的国内产品。预计未来电子商务销售额将继续增长，网上购物将越来越受到世界各国的欢迎，将在世界范围内进一步普及。
中国跨境电子商务的运作一般是指海外消费者在Amazon、eBay等更广泛使用的平台上进行网上购物，并在订购后支付第三方支付机构；收到订单后，香港公司通知物流服务提供商接收货物。亚马逊和eBay最终将资金从海外仓库或物流服务提供商转移到海外消费者手中。在这种经营模式下，如果香港公司直接向终端消费者邮寄进口，则可以在消费场所免征增值税。不过，这也是“第一支柱”强调的信号之一，即加大市场管辖权的征税力度，根据消费者的实际所在地征税。
考虑到国际税制改革方案的多重不确定性，跨境电子商务可预见的变化是，它将不可避免地遇到更多的税收遵从和风险管理。由于境外跨境电商业务模式多样，建议根据不同的业务模式管理相应的营业收入和财务报告亏损。这将有助于确定各类业务收入是否达到第一支柱的门槛，确定海外市场是否构成“远程纳税地址”，以及市场管辖区对利润与机构亏损相匹配的承诺。
然而，值得注意的是，这也将使核心成本的分配更加困难。同时，引入新的记账和纳税申报方式，考虑在纳税申报中填写第三方分销商/海外网店信息，有助于确定跨国公司中哪些实体获得了视同剩余利润，或者按照高于确认的正常利润率的比例承担纳税义务，或者拥有相关的知识产权技术。
随着税收信息和范围的扩大，对跨境电子商务的数据采集和管理能力提出了更高的要求，特别是对目的地消费者的数据采集和目的地销售利润分配提出了更高的要求。在改革全面实施之前，跨境电子商务企业可以开始加大研发投入，特别是在大数据的探索和应用方面，国内技术服务企业也可享受研发费用附加扣除。
