海关对网购保税商品在区域(中心)内保税仓储及卡口实施账册管理，其显著特征就是保税备货。不管是哪种保税仓库，其管理的对象都是货物，反映在会计科目上，都应划人“材料物资”或“库存商品”，但保税仓库具有自身的特殊性(缓办纳税)，与其他仓库有所不同，根据海关监管要求，要求保税仓库设置“账”“卡”，实行“三账一卡”与“两账一卡”的制度。
(1)“三账一卡”：适用于公用型保税仓库
公用型保税仓库因其货主多、数量多，必须建立严密、完整的库房财务管理制度。“三账”是指财务部门设置一套较详细的商品明细分类账，科目为“材料物资”或“库存商品”，进行数量、金额的核算;业务部门设置一套商品调拨账，只记数量即商品的收、付、存，不记金额，记录进出库商品的流向与构成；保管部门设置一套商品保管账，记录商品收、付、存的数量和金额，掌握进出库商品的实际动态，即进出商品的原始记录。月底，仓库保管员根据出入单编制“领用材料明细表”，与财务、业务部门对账。
“一卡”是指仓库保管员根据货物出人库的实际记录填制的卡片，记录库存商品的增减变化情况，由仓库保管员保管。
(2)“两账一卡”：适用于专用保税仓库
“两账”是指财务部门和保管部门各做一账，可以互相监督、制约，同时又能了解进出库商品的全面(数量、金额)情况。财务部门直接在“材料物资”或“库存商品”借贷方反映库存商品保管账，但只记数量即商品的收、付、存，不记金额。月底，对出入库次数较多的，仓库保管员根据出人库单编制“领用材料明细表”，与财务对账。“一卡”即根据货物入库单，对入库商品按品名、规格、型号逐项记录入卡，形成卡片档案，再根据出库单登记出库情况。这是构成仓库保管部门最初的原始记录，也是最真实的。
对其合规审核的侧重点：
①审核重点敏感商品进出库报关单和进出库报表、出库单等有关单据材料是否齐全有效，审批手续是否合法。
②审核是否存在超范围经营、其他贸易方式货物假借跨境电商名义入库等情况。通过将入库单与“材料物资”或“库存商品”账户核对，核对货物品名便可发现此类情况。
③审核是否存在未办手续擅自出库情况。可以盘库清点实物，查阅“材料物资”或“库存商品”账发现问题。
④核查只在账面作业而无实际出库情况。通过核实出库单、入库单及保管员手中的卡片可以查明。
⑤核查重点敏感商品的出库流向。将海关核准的出库单与仓库保管员实际开出的出库单或卡片及“材料物资”或“库存商品”账进行核对，核查实际领料单位。
⑥核查有无超期货物。将入库单上的日期与“材料物资”或“库存商品”账上的库存数相对比，再盘点实物即可查明。
