在保税备货模式中，库存管理是至关重要的环节，涉及库存转移、冻结、补货、清库存以及与海关台账的协调等多个方面。合理有效的库存管理策略对于保障货物的正常流转、遵守海关监管规定以及提高运营效率具有重要意义。
一、库存转移
货物批次属性、货主所有权转移需同步信息给海关申报平台以确保监管。
二、库存冻结
（一）循环盘点差异
保税物流中心每日对货主库存盘点，有差异时申请冻结，经货主确认后系统冻结差异库存但不调整。
（二）补货情况
入库到货少于预入库单数量且采用补货形式时，到货商品正常上架但为冻结状态无法销售。
三、补货范围界定
（一）补货策略
包括根据拣货位库存下限自动触发和订单驱动补货。
（二）应对大型促销
跨境电商平台因 SKU 多且有大型促销，采用动态补货方式，商品操作周期内使用拣货位，结束后让给其他商品，提高拣货区资源利用率和拣货效率。
四、确定清库存活动品类范围
仓库管理人员根据库龄、临近失效日期等查询库存余量，确定清库存活动品类及促销策略，定期管理查询和清库存活动可预防库存周转问题，部分品类季节性、节日性促销可提高库存周转率。
五、商检不通过货品存放
保税出库商品分拣时商检抽检，信息不一致等情况导致商检不通过的商品暂放商检查验区，待商检质量判断后进行出库销毁或退运等后续工作。
六、库存与海关台账
（一）盘点差异处理
仓库定期内部盘点，差异时与海关系统比对，查询报关单情况，不符时以一般贸易申报纳税调整库存差异。
（二）原因查找
包括入库时海关上架操作和出库时快递公司在海关卡口处核注。
七、跨境自营仓中不同商家间库存转移
跨境自营仓中不同商家 SKU 重合且有缺货存货情况时可进行库存转移，在跨境公共仓因备案商家特点不同一般不存在这种情况。
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