进口支付企业应办理海关备案登记。海关规定：跨境电商支付企业等参与跨境电商零售进口业务的企业，应当依据海关报关单位备案管理相关规定，向所在地海关办理备案。跨境电商零售进口商品由境内消费者购买，经境内支付企业完成支付主要操作，相关支付操作应严格符合境内监管规定。
支付企业如果参与进口通关业务，应在境内海关办理备案手续，接受境内海关监管；相比较而言，跨境电商零售出口商品由境外消费者购买，经境外支付企业完成支付主要操作，就难以要求境外支付企业必须在境内海关备案。
支付企业在交易中根据订单支付指令提供支付服务，在进出口通关环节主要提供支付电子信息，属于配合完成交易的从属角色；在海关办理备案后，支付企业拥有了唯一的海关备案编码，获得了向海关传输支付电子信息的资格，同时被纳入了海关监管范围，应遵守报关单位海关监管规定，配合海关监管。
支付企业应依法传输支付电子信息。
海关规定：跨境电商零售进口商品申报前，支付企业应当向海关传输支付电子信息，并对数据真实性承担相应责任；直购进口模式下，邮政企业、进出境快件运营人可以接受支付企业的委托，在承诺承担相应法律责任的前提下，向海关传输支付电子信息。
在跨境电商进口交易中，消费者如果在境内交易平台购买商品支付价款，由境内支付企业提供支付服务，可由支付企业直接向海关传输支付电子信息；在直购进口模式下，支付企业面向全球消费者时，很难做到所有购买商品的消费者所在地都设立分支机构，这种情况下，就可以委托邮政企业、进出境快件运营人向海关传输支付电子信息，确保商品通关信息完整。
海关规定：跨境电商零售出口商品申报前，跨境电商零售企业或其代理人应当向海关传输收款等电子信息，并对数据真实性承担相应法律责任。在支付操作中，消费者支出价款，跨境电商零售企业收取价款，支付与收款应该是严格对应的，跨境电商零售出口交易中，境外支付企业提供支付服务，难以在境内办理通关手续，跨境电商零售企业或其代理人可向海关传输收款等电子信息，佐证消费者支付信息，确保商品通关电子信息齐全完整，降低支付电子信息传输难度，促进跨境电商零售出口发展。
