商业主体成为独立通关主体。
跨境传统货物进出口监管主要涉及直接与通关相关的商业主体，包括境内收发货人、境外收发货人、进口消费使用单位、出口生产销售单位、申报单位等，一般不涉及其他商业主体；重点对通关环节主体行为实施监管，例如申报、提交监管证件、缴纳税费、实货检查等，一般不涉及非通关环节主体行为。跨境电商零售相关企业依法向海关传输电子信息，提前办理海关登记手续，获得主体唯一标识， 将在海关信息化系统中建立诚信底账，成为通关主体。
接受海关监管，在海关备案登记的企业还应当接受海关稽核查。跨境电商零售进口监管涉及跨境电商平台企业、跨境电商零售企业境内代理人、支付企业、物流企业、申报企业、直购进口模式还涉及邮政企业、进出境快件运营人跨境电商零售出口监管涉及跨境电商零售企业及其代理人、物流企业、申报企业，不仅涉及直接与通关相关的商业主体， 还涉及通关前的支付环节和通关后的物流派送环节，增加了支付企业和物流企业，让更多与交易相关的商业主体成为独立通关主体，发挥辅助通关监管作用，承担相应通关责任。
电子信息独立存储难篡改。
跨境传统货物进出口报关单及随附上传的商业单证的电子数据，独立保存在通关信息化系统中，由海关提供安全存储保障，属于中心化存储数据。《申报清单》及交易、支付、物流等电子信息集中保存在通关信息化系统中，但保存的电子信息主要涉及与通关直接相关的商业数据，属于根据监管要求从企业经营原始数据中提取并转换格式后的部分数据，完整的企业经营原始数据依然独立保存在企业信息化系统中，由企业提供安全存储保障、掌控数据管理权限、承担数据真实性责任，难以被其他企业擅自篡改作假。
电子信息包含与企业经营数据关联的数据，例如交易电子信息包含交易平台的订单编号、物流电子信息包含物流企业的运单包裹面单号、支付电子信息包含支付企业唯一的支付流水号等，可通过关联数据准确定位企业经营数据，必要时海关可通过企业依法开放的共享端口实时提取相应商业数据，使用企业独立存储的完整原始数据对向海关传输的电子信息进行验证，防范传输过程中篡改电子信息的风险。
