跨境电商零售商品进口通关时，应接受海关实货检查，可能《申报清单》被海关实货检查指令命中， 要求企业找出对应商品提供给海关核实，经海关实货检查确认商品与《申报清单》相符，才能放行允许提离派送；如果末找到《申报清单》对应的商品、商品与《申报清单》不符，甚至发现另有商品末填报《申报清单》，将涉嫌违反监管规定，需要办理异常处理手续，接受海关处罚，承担相应后果，还可能要求企业对其他全部商品分好货、找好货、对好清单，配合海关逐票实货检查，消除其他商品单货不符的风险，将显著增加企业通关成本和商品通关时间。
跨境电商零售直购进口商品从境外打包发运，外观包装千差万别，没有鲜明统一的外观标识， 要根据包装表面的运单信息确定对应《申报清单》，需要人工细心认真核对，单批种类多、数量大，要在海量商品中快速分好货、找准货、难度很大。跨境电商零售直购进口商品通常从一线口岸进境经过境内途中运输进入监管场所，可能在口岸进境环节需要接受海关实货检查，在监管场所环节也要接受海关实货查验。
应分段配合海关实货检查：在一线口岸主要以人工方式分货找货，使用进境前理货清点形成的装箱清单，找出《申报清单》所在的运输包装容器，根据商品外包装编号标识确定对应商品；在监管场所主要以分拣线分货找货，通过与海关信息化系统联动的分拣流水线设备，接收海关实货检查指令，识别商品运单编号，找出商品流转给海关检查，提高商品分货找货效率。
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