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部分生产企业已经成功申请外贸经营权，却依旧选择委托外贸公司代理出口业务，这种情况在外贸行业中十分常见。不同企业结合自身实际情况，会做出差异化的合作选择。

部分海外客户有明确合作要求，只向生产制造厂下达订单，不接受中间商参与。面对这类客户，制造厂只能自行办理出口，无法委托外贸公司操作。

国内出口退税率执行标准统一，但各省份退税到账速度存在明显差距，直接影响企业资金周转。退税流程办理较慢地区的生产企业，常会委托退税效率更高地区的外贸公司代理出口。不同省市退税到账时间最多可相差三至六个月，企业愿意支付百分之一至百分之二的代理费，以此加快回款速度。另外，长期合作已形成固定合作主体，客户系统内的供应商信息难以变更，也是企业继续沿用原有代理渠道的原因之一。

新获批外贸经营权的企业，还会面临监管层面的问题。海关、商检、外汇核销等环节，对新自营出口企业的管理和查验更为严格。这类企业对相关政策、报关及核销流程不够熟悉，遇到交货期紧张的订单，为规避风险、保障按时交货，依旧会选择原有外贸公司代理出口。

上海、宁波、天津、厦门、广州等城市的外贸代理服务更为专业，当地银行针对进出口业务的配套服务也便捷高效，银行审核外贸单据专业且迅速。部分地区银行相关服务不够及时、专业，容易引发各类问题。因此不少拥有自营出口资质的企业，愿意支付百分之二左右的代理费，借助大城市外贸公司的专业服务，将自身精力聚焦在核心业务上。