为了培养消费者的线上支付习惯，积累足够的用户流量，支付宝在2004年成立时，就对注册用户实行完全免费的政策。虽然借助这种免费策略，支付宝平台迅速做大了电子商务交易规模，但平台本身却一直是处于亏损状态。即便到了2007年支付宝开始对商户收取费用，但在短期内仍然没能改变亏损的状态。
不过，随着电子商务的深化发展，支付宝平台用户也呈现爆炸式增长。从2009年下半年开始，支付宝扭亏为盈，实现盈利。并且，随着用户规模的进一步扩大，以及国内外电子商务市场的发展成熟，支付宝也不断细分市场，推出更多的增值服务，从而拓展了创收渠道。
例如，2012年2月，支付宝平台专门为跨境电商交易推出了支付宝跨境快捷支付方式：用户将银行卡与支付宝账户绑定，即便没有开通网上银行功能，也可以通过账户支付密码和手机动态验证码，快速完成跨境支付。
与PayPal相比，支付宝不仅交易手续费更低，而且提现是完全免费的（PayPal会收取一定的提现费用）。这使得支付宝在国际第三方支付平台的竞争中更有优势：2009年7月，支付宝超越PayPal,成为全球最大的第三方支付平台。
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