国际海运集装箱班轮运费由班轮公会和班轮经营人确定，它们多与经营成本密切相关，在一定时期内保持相对稳定。
(1) 拼箱货运费计算。
根据不同商品，班轮运费计收标准通常分为下列几种：
①按货物实际重量计收运费，称为重量吨 (Weight Ton)，运价表内用“W”表示。
②按货物的体积/容积计收，称为尺码吨(Measurement Ton)，运价表中用“M”表示。
③按重量或体积从高计收，即由船公司选择其中收费较高的一种作为计费标准，运价表中用“W/M”表示。
④按货物 FOB 价收取一定百分比作为运费计收，称为从价运费，运价表内用“A.V.”或“Ad.Val.”(拉丁文Ad Valorem，意为“从价”)表示。
⑤按货物的重量、体积或其 FOB 价收取一定百分比计收，即在重量吨、尺码吨和从价运费中选择最高的一种标准计收，在运价表内用“W/M”或“A.V.”表示。
⑥按货物的重量或体积，再加上从价运费计算，即先按货物重量吨或尺码吨中较高者计算，然后加收一定比例的从价运费，在班轮运价表中用“W/M plus Ad.Val.”表示。
运费的计算步骤为：
①选择相关的运价本；
②根据货物名称，在货物分级表中查到运费计算标准和等级；
③在等级费率表的基本费率部分，找到相应的航线、启运港、目的港，按等级查到基本运价；
④从附加费部分查出所有应收 (付) 的附加费项目和数额 (或百分比)及货币种类；
⑤根据基本运价和附加费算出实际运价；
⑥运费=运价 x 运费吨。
【例】公司出口到某国家商品1000箱，每箱体积为40cm x 30cm x 20cm，毛重为30kg。经查，该商品计费标准为 W/M，等级为10级，每吨运费率为 200 港币。另查得知该国要加收港口附加费 20%，问：公司应付轮船公司多少运费？
解题：商品总体积= (0.4 x 0.3 x 0.2) x 1000=24m³
因为该商品计费标准为 W/M，总重量>总体积，所以运费吨以 W 为标准，即30FT。
海运运费=基本运费+港口附加费
基本运费=运价 x 运费吨=200X30=6000(港币)
港口附加费=6000 x 20%=1200 (港币)
海运运费=6000+1200=7200(港币)
(2) 整箱货运费计算。
根据现行情况，整箱货海运运费计算基本有两种方法：一是类同普通杂货班轮运费计算方法，对具体的航线按货物的等级确定相应基本费率，并按规定的计费标准计算运费；二是按航线以每一个集装箱作为计算单位计算包箱运费。
包箱费率(Box Rates)，是船公司根据自身情况以不同类型的集装箱为计费单位，确定整箱货的不同航线包干费。包箱费率可分为两类：一种是考虑航线、货物等级和箱型等因素计费标准计收基本运费，又称货品包箱费率(Commodity Box Rates，CBR)；另一种是不分货物种类，也不计货量，只按航线和箱型规定统一的集装箱的基本海运费，又称均包箱费率(Freight for All Kinds，FAK)。
集装箱海运附加费通常有以下类别。
超重附加费：仅拼箱货收取，如果集装箱交接形态为 FCL-LCL或LCL-FCL 则按50%计收。
超长附加费：仅拼箱货收取，如果集装箱交接形态为 FCL-LCL或 LCL-FCL 则按50%计收。
燃油附加费：指因国际市场上燃油价格上涨而征收的附加费。集装箱分别按拼箱货和整箱货不同计算标准征收。如整箱货以 20ft 或40ft 一个箱子加收若干元征收。
货币贬值附加费：指船公司为弥补因收取运费的货币贬值造成的经济损失而向托运人收取的费用。一般随着货币贬值的幅度按基本费率的一定比例收取。
港口拥挤附加费：在集装箱运输中主要指港口拥挤或集装箱进出不平衡，导致船舶长时间等泊或集装箱在港积压而增收的附加费。
选港附加费：集装箱运输仅整箱货收取。因拼箱货关系到不同收货人，船公司通常不接受选港的要求。整箱货选港附加费以每箱 (20ft /40ft)计收。
变更卸港附加费：仅整箱货收取。因拼箱货关系到不同收货人，船公司通常不接受变更卸港的要求。整箱货变更卸港附加费以每票计收。
空箱调运费：由于调运集装箱空箱而征收的一种附加费。
旺季附加费：对集装箱货源旺季船公司舱位不足所征收的一种附加费。
港口附加费：某些港口(包括基本港和非基本港)的情况比较复杂(如船舶进、出需要通过闸门)，装卸效率低或者港口费较高，在这种情况下，都会增加承运人的运输经营成本，承运人为弥补这方面的损失，所增收的附加费。
转船附加费：海上承运人将所承运集装箱货物从基本港转运到非基本港(托运人指定的目的港)，为此额外多支出转运的费用。在这种情况下，海上承运人需向托运人加收转船附加费。
