跨境电商申报出口退税，除办理进出口资格外，还需在税务局办理出口退税（免）税备案，以下是操作流程。
1、网上备案流程
登录电子税务局：我想办税-出口退税管理-出口退(免)税企业资格信息报告-出口(退)免税备案-网上申报。
2、填写申报材料
退税税务机关：生产企业选择各区分局，外贸企业选择深圳市国家税务总局第二税务局；
退（免）税计算方法：生产企业选择“免抵退税”，外贸企业选择“免退税”，小规模纳税人选择“免税”；
是否有零税率：是否有类似的研发设计、劳务出口等业务，如果没有，选择否，如果不是出口零税率应税服务，选择否；
退税账户托管标志：选择否；
享受增值税优惠政策：根据自己的实际业务情况进行勾选，如果没有就不填写，一般不勾选；
海关企业代码：填写《中华人民共和国海关报关单位登记证》或《海关进出口货物收发货人备案收据》中的《海关登记代码》（共10位），虽然不是带*必填项目，但建议填写，如果不填写，将无法匹配企业的关单信息；
备案登记号：填写《对外贸易经营者备案登记表》上的备案登记表号（共8位），也可不填写；
办税人员电话：填写负责税务人员的电话号码，如有变更，应及时修改，避免无法联系，影响企业退税进度；
退税开户银行：选择在税务机关备案并设置退税账户标志的账户；
退税管理类型：建议检查无纸化企业，无需向税务局提交纸质资料，只需将电子数据传输到税务局，纸质资料保留备查；
应税服务代码：根据自己的实际业务情况检查，如果没有，就不填写，一般不勾选。
填写上述内容，确认后，将备案表和电子数据传输到电子税务局。
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