1.提货速度更快
“两步申报”模式下，凭借提单信息完成概要申报，完成必要的口岸查验后，即可提离，不必等到完税，提货速度大大加快。货物在码头滞留时间得以减少，避免了传统模式下遇到载货船舶已抵港但商业单证未备齐而无法报关的情况。
2.通关成本降低
通过“两步申报”模式，企业可以在提供担保的前提下进行概要申报，不需要实际缴纳税款就能将货物提离口岸，在完整申报时再完成税款缴纳。担保的形式可以是保证金、银行保函或者保证保险，而且高级认证企业可以向海关申请免担保，即无须向海关提供任何有形的担保方式，仅凭企业的良好信用即可享受先放行货物后缴纳税款的待遇，可有效降低企业财务压力。
3.申报差错率减少
“两步申报”改革前，企业需一次性完整申报105个项目，收集申报信息和备齐单证的通关准备时间较长，且容易引发申报差错。
改革后，概要申报内容不到完整申报项目的1/5，从申报内容和时限来看，企业有更充裕的时间获取货物信息、准备报关资料，漏报、错报等情形会有效减少，可降低因申报差错引发的信用等级下调风险。
4.政策叠加效应明显
(1)“两步申报”+“汇总征税”
“两步申报”报关单采用“汇总征税”模式纳税的，企业的汇总支付时限为完整申报计税处理完成后下一个月的第5个工作日结束前，缓税期会更长。
(2)“两步申报”+“提前申报”
对应近海运输的进口货物，在传统模式下因单证不齐不能提前申报，常常发生货物已抵港却不能及时申报，从而产生滞港费等问题。在“两步申报”模式下，不用等到单据齐全，仅凭舱单数据及电子文档即可提前申报，货物到港即放行提离，14天内凭原始凭证完成完整申报并缴税即可。
5.配套措施完善
各海关都在积极完善各项配套措施，服务企业运用“两步申报”通关模式，帮助企业尽快熟悉流程，为通关再提速。
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