单证全流程无纸化。海关在早期全流程使用纸质单证：企业手写纸质报关单，住份提供纸质监管证件和随附单证，海关使用纸质单证实施全流程作业，审核单证，计征税费，查验货物，签章放行，出具报关单证明联。后来不断推进通关无纸化改革，逐步提升信息化水平，实现通关单证无纸化，要求通过信息化系统填制申报报关单电子数据，允许上传合同、 发票、装箱单等商业单证，允许网上支付、电子支付、担保支付等无纸化支付方式，与场站作业信息化系统联动获取物流信息、传输监管要求，完成监管证件全部无纸化联网，实现了跨境传统货物全流程无纸化作业。
跨境电商零售通关模式吸收了跨境传统货物无纸化改革经验，要求除特殊情况外，《申报清单》应当采取通关无纸化作业方式进行申报。实现法定通关单证无纸化；为了支持跨境电商零售发展，简化了跨境电商零售禁止和限制进出口规定，相应减少了通关涉及的大量监管证件，解决了监管证件无纸化难题；基于互联网信息交换的跨境电商零售交易操作，直接获取互联网产生的电子信息，弃用传统纸质商业单证，实现随附商业单证无纸化；借鉴跨境传统货物无纸化通关模式，直接应用信息化系统数据实施监管作业，记录作业结果，使用电子签名。发送放行信息，实现监管作业无纸化。跨境电商零售通关模式顺应互联网新业态的特点，实现全流程无纸化，为跨境电商零售商品高效通关奠定基础。
电子信息统一规范。 跨境传统货物经常涉及的随附单证是合同、发票、装箱单等商业单证，通过上传文件方式作为报关单随附单证，任何纸质单证都可扫描为指定格式文件上传，没有统一规范内容和格式要求。跨境电商零售试点初期，为了探索适应新业态的监管措施，各地试点海关都深入研究跨境电商新业态，分析确定监管重点，构建本地通关监管模式和信息化系统，形成了各具本地特点、未完全统一的单证电子信息。
在总结各地试点经验基础上，海关统一规范了跨境电商零售商品法定通关单证，专门设计使用《申报清单》，取代跨境传统货物报关单，明确《申报清单》与报关单具有同等法律效力；统一规范了跨境电商零售商品随附单证电子信息，进口应传输交易、支付、物流等电子信息，出口应传输交易、收款、物流等电子信息，没有其他随附单证；统一规范了传输责任主体，对于进口商品，跨境电商平台企业或跨境电商零售企业境内代理人传输交易电子信息，支付企业传输支付电子信息，物流企业传输物流电子信息。
对于出口商品，跨境电商零售企业或其代理人传输交易、收款电子信息，物流企业传输物流电子信息，传输主体对数据真实性承担相应责任；统一规范了传输方式，即通过国际贸易“单一窗口”或跨境电商通关服务平台向海关传输，全部单证电子数据使用数字签名技术，消除了各地差异较大的本地化传输方式；统一规范了报文对接标准，包括报文结构、数据及格式、回执、签名、错误信息、对接流程等，明确业务节点报文适用于使用跨境出口统一版客户端软件接入统一版系统， 终端节点报文适用于跨境电商相关企业自行研发接入统一版系统， 传输节点报文适用于第三方平台接入统一版系统， 满足企业不同接入方式。
电子信息统一规范让企业仅需建设一个接入传输系统，改造一次业务系统，满足全国口岸通关需要，显著降低企业传输投入成本；让全国海关使用相同电子信息实施监管，为统一规范监管执法奠定数据基础。
