根据美国专利商标局对商业方法专利给出的定义，商业方法专利是指:装置和对应的方法，用于商业运作、政府管理、企业管理或财务资料报表的生成，它使资料在经过处理后，有显著的改变或者完成运算操作;装置及对应的方法，用于改变货物或服务提供时的资料处理或运算操作。
以某个电子商务网站为例，该网站实现的是版权出版物(传统出版物和数字出版物)的销售，它具有一定的实现方法，这属于一种思想上的逻辑方法，如果通过软件编写并结合计算机实现，那么这样的一个技术方案，只要满足了专利的三性(新颖性、创造性、实用性)，是完全可以请求以专利的形式进行保护的。
这里同时涉及软件的保护方式问题，通常软件可以采取著作权的方式进行保护，也可以采用专利的方式加以保护。但是软件著作权保护的侧重点是表达的方式，是编程语言的组织形式，通常只有结构相同或实质相同才有可能构成侵权。
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