网上银行涵盖了国内、国际各大银行机构。各大银行机构的网上银行支付与结算的流程虽存在部分差别，但总体来说，网上银行支付与结算由以下六个步骤组成。
第一步:客户接入互联网，通过浏览器在网上浏览商品、选择货物、填写网络订单、选择应用的网络支付与结算工具，并且得到银行的授权使用，如银行卡、电子钱包、电子现金、电子支票或网上银行账号等。
第二步:客户机对相关订单信息如支付信息进行加密，在网上提交订单。
第三步:商家服务器对客户的订购信息进行检查、确认，并把相关的、经过加密的客户支付与结算信息转发给支付网关，由银行专用网上银行后台业务服务器进行确认，待通过银行等电子货币发行机构的验证后，得到支付资金的授权。
第四步:银行验证确认后，通过建立起来的加密通信通道，经由支付网关给商家服务器回送确认信息，同时为进一步保证账户安全，给客户回送支付与结算授权请求。
第五步:银行得到客户传来的进一步授权支付与结算的信息后，把资金从客户账户。转拨至开展电子商务的商家账户中，借助金融专用网进行支付与结算，并分别给商家、客户发送支付与结算成功信息。
第六步:商家服务器收到银行发来的支付与结算成功信息后，给客户发送网络付款成功信息和发货通知。至此，一次典型的网上银行支付与结算的流程结束。商家和客户可以分别借助网上银行查询自己的资金余额信息，以进一步核对。
由于跨境电商支付与结算和国内电商支付与结算，在商品交易的区域范围上存在差异，因此二者在使用网上银行支付与结算的流程上也存在部分差异。
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