在出现跨境电商之前，邮件、快件及贸易是三类合法通关形式，水客、灰色渠道及走私等非法渠道也是存在的。随着进口包裹量剧增，相当一部分跨境电商进口就被扣上了“灰色海淘”的锅。
货物及个人物品类快件在通关中几乎每票必检，经海关审核无误并符合有关规定的，海关在申报单上加盖放行章，但不能排除低报漏报货物价值来逃税的情形。邮件的申报和查验流程相对简便，海关对个人邮递物品实行抽检查验，清关抽检率具有随机性，只在超出“自用、合理”标注等情况下，才申报纳税等海关手续。
海关因人力、物力、效率等因素，无法逐票对每个零碎的邮包进行拆包查验判断货值、商品种类是否符合监管要求，而且还要断定是否是个人使用还是转手倒卖，因此包裹有个综合抽查率，意味着部分的海淘快件邮包可能不被征税，便形成了基于这些漏洞的“灰色清关”。同时，正常通关流程的拥挤也在一定程度上刺激了非法渠道。
各国海关对于进出口实物都有“货物”和“物品”的划分，两者按“是否有贸易属性”区分，纳入不同的监管框架和制度流程下，申报要求、进口税率及法律责任。入境商品清关的基本原则是对个人物品免征税、少征税，对贸易物品在符合国际贸易规则的前提下合理征收。
货物，采取贸易B2B方式下的监管，通常为“一关三检”，海关根据不同货物征收关税、增值税、消费税，商品须申请商品检验、动植物检疫和卫生检疫，单证必备、税费必缴，关境监管的税收风险更多在于货物同报关单不符，通过企业信用管理及抽查来规避。
物品，采取行邮(行李和邮件)方式监管，个人物品进口要“如实申报”，原则上须按法律要求主动申报，按章缴纳“行邮税”，个人享有免征额，但尺度上突出“自用、合理数量”，越界则会被视为“货物”。
跨境电商不是一般贸易，因为进口一方是消费者，消费者购买商品不是为了贸易或转售，而是自用;但跨境电商也不是个人寄送的物品，是电商企业的一种进口贸易销售行为，现有的个人物流监管流程也无法适应如此大规模。2014年56号文执行之后，标志着跨境电商的合法化，享有税收优惠和新通关便利。
跨境电商两种进境通关模式“直购和保税”都是基于电子化。海关商检与电商、支付、运输渠道及仓储企业的系统对接，多方协同作业、信息共享，利用企业、商品、用户等信息备案，“电商企业提供的报关单、支付企业提供的支付清单、物流企业提供的物流运单”三单信息一步到位，自动合成清单、集中向海关申报，实现跨境电商进口的“一次申报、一次查验、一次放行”。
新模式下，跨境电商的全程信息向政府与海关透明化，便利居民海外购物、实现进口散件阳光纳税，帮助政府利用大数据实现科学、透明、规范的管理。
