除了上述的一些方法外，海关稽查人员还在工作中采用下面的一些方法辅助稽查。
1.银行调查法
主要是针对被稽查人收付汇单据或国内收付款凭证有涂改或涉嫌伪造的，通过银行调查了解被稽查人收付汇或国内收付款的真实情况。
2.实地核查流向法
在货物通关后实地察看货物是否已经到达规定的场所。此做法主要针对以手册、减免税等方式进口的货物。
3.生产能力分析法
主要是通过对被稽查人加工贸易进口量与其实际生产加工能力的比较，分析被稽查人的进出口情况是否正常。
4.查阅仓库记录法
通过查阅货物每次进出仓库的详细记录，核查进出口货物的使用、流向是否合理。
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