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进口许可证一经签发不得擅自更改内容，因故需更改（含删除、核销、延期、遗失换证）时，须在有效期内提出申请。发证机构区分未使用、已部分使用、遗失等不同情形，经系统核验或书面核实后办理删除、核销、换发新证，并在新证备注栏注明原证证号与换证字样。

1.经营者申请更改进口许可证纸质证书时，发证机构应要求经营者提交加盖经营者公章的"中华人民共和国进口许可证更改申请表"和进口许可证原件以及《进口许可证申请签发使用工作规范》第七条所列相关材料，并经核验程序换发新证。

2.对于未使用的进口许可证，发证机构办理经营者提出的更改时，应先通过"预删除"进行系统数据核验。核验通过的，在发证系统中点击"删除"，完成删除操作；核验不通过的，退回经营者并说明原因。

3.对于已部分使用的进口许可证，发证机构办理经营者提出的更改时，应先通过"预核销"进行系统数据核验。核验通过的，在发证系统中核销已使用数量；核验不通过的，退回经营者并说明理由。

4.已领取的进口许可证纸质证书如遗失，经营者应立即书面报告原发证机构。

经营者如需重新办理进口许可证，发证机构应予以受理，凭经营者的书面报告等材料，与海关电子清关数据核实无误后，删除或核销原证并换发新证。

5.发证机构在办理进口许可证延期和遗失手续时，应根据情况在新证备注栏注明原证证号和"延期换证""遗失换证"字样。