跨境电商海运头程运输使用的运输工具均为集装箱班轮,因此在运费计算方面，海派的头程运费计算与集装箱班轮运费计算方式一致，计算公式为：
集装箱班轮运费=运价X集装箱个数十附加费
整箱货在实践中的报价通常是all in rate(包干费率)。包干费率是指基本运费率和各项附加运费率之和。
无论是拼箱货的运费还是整箱货的运费,均包含了海上运输的费用和装卸船的费用。海运费的附加费包含燃油附加费、货币贬值附加费、港口拥挤附加费、战争险附加费、选港附加费等。具体根据目的港的性质(基本港或非基本港)、运输期间的港口情况、目的港政府政策要求等决定。其中,附加费一般为运费的一定百分比。
在实际操作中,使用海派运输单件货物的重量需在100千克以上,若不满100 千克的货物,按 100 千克计算。
燃油附加费多数为远洋航线旺季临时使用，主要是因国际市场燃油价格上涨而征收的附加费。
货币贬值附加费是指船公司为了弥补因收取运费的货币贬值造成的经济损失而向托运人收取的费用。
港口拥挤附加费俗称码头拥挤费,凡是塞港的码头都有可能收取。北非、以色列等一些国家(地区)的港口常年收取。
战争险附加费是指在战争地区收取的费用,如在战火纷飞的中东巴以边境地区,常年收取。
选港附加费是整箱货需收取的费用,以箱(20英尺/40英尺)为单位收取。
此外还有转船附加费、旺季附加费、码头操作费等,由不同港口根据实际情况收取。
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