补偿贸易是一种比较复杂的交易，涉及贸易、信贷和生产，而且持续时间又比较长，在履约期间，往往会发生一些难以预料的变化。因此，进行一项补偿贸易，尤其是大型的补偿贸易，应特别注意以下几个问题:
(1)必须做好项目的可行性研究，立项时必须慎重考虑。
(2)合理计算贷款的成本和安排偿还期。对于贷款成本，既要考虑利率的高低，又要考虑所使用的货币是软币还是硬币，还要考虑设备价格的高低。只有从这三个方面进行综合核算，才可能得到比较理想的成本。
(3)正确处理补偿产品和正常出口的关系，原则上应该以不影响我国的正常出口为前提。为此，必须在出口数量、销售市场和定价方面予以充分注意。
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