事务由财政部下属的联邦税务总局负责。根据巴西海关条例，巴西海关系统(SISCOMEX)是所有进出口货物报关程序的登记网站，所有的海关事务由财政部下属的联邦税务总局具体负责。一般来说如果在SISCOMEX 输入了货物申报单则报关程序开始，与此同时，进口商还需按要求向海关提供相关单证，海关会对货物申报的内容一一进行核实，核实一致后SISCOMEX则会授权进口商提货。虽说联邦税务总局负责海关事务，但是进口流程中每一个环节都由不同的机构负责。
NCM CODE 或者 NCM NO.是指巴西的海关编码，巴西海关要求入境到巴西的货物都必须在运单提单上显示其对应的NCM CODE。
进口商在SISCOMEX中登记进口报关文件后，报关文件将会被系统自动提交，并根据进口商纳税、贸易行为、进口货物性质、数量及价格、征税情况、货物原产地、出口地、进口商运营能力和经济实力等多种因素进行分析后，被分配到不同的清关通道实施分类抽检，即按照以下五种不同标识的通道对货物进行分类处理。
(1)灰色标识:报关文件、货物和商品价值需经检查后方能通关。
(2)红色标识:报关文件和货物需经检查后方能通关。
(3)黄色标识:报关文件经检查后方能通关。
(4)西瓜标识:根据对报关文件的查验结果将货物归入红色标志或绿色标志。
(5)绿色标识:报关货物可全部免检并自动通关。但是海关官员有权对其重新进行分类。
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