物流的风险主要是指承运过程中货物流通时会产生的风险，主要包括不可抗力风险，货物短缺、遗失风险，运输延迟风险这几个方面。
不可抗力风险：主要是由于自然的原因，或者说非人力故意造成的一些原因导致货物延迟、丢失、损耗等的损失。不可抗力风险包括狂风暴雨，影响轮船的航期、飞机的飞行；海上风浪浸湿集装箱导致货物受潮;轮船、飞机的故障，等等。这些都会对货物的运输造成风险，最终引发客户的不理解，从而导致客户少付或者拒付货款等现象，严重的直接丢失客户，也收不回货款。
货物短缺、遗失的风险：这个风险主要发生在拼箱、空运货物上，由于运输途中种种原因导致到达目的地以后货物数量与原来不符，甚至直接消失。空运中特别是对于一些几十千克的小货，在中转的时候容易出现丢失，或者是大量的货物有很多件的时候，在空运、海运装运过程中最容易出现短缺的现象，最为严重的是货值很高的货物，在运输途中被人为遗失。但是运输环节过多，很难追查，最终结果不仅要赔偿客户，关键的是会丢失客户。
运输延迟风险：运输过程中的每一段，都有可能出现延迟，不管由于什么原因都会导致一些风险的产生。集装箱内陆托运时，由于前一个柜子装货缓慢导致后一个柜子到工厂时工人已经下班，没有人装柜；海上运输展品时，由于航行时间慢了两天错过了展会；空运货物时，由于飞机货多，落下来一些货物；国外段由于代理错估时间，预报发送比预期早了一周等，这些延迟直接会导致客户对货代业务员的不信任，从而更换新的货代业务员。
对待物流风险中的不可抗力和货物短缺、遗失这类风险，最好在货物出运前建议发货人购买相应的保险，并且货代公司自己也需要向保险公司投保相关的保险，在双重保障的情况下，尽可能将发货人和自身的风险降到最低。
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