从海关的监管角度来看，进口跨境电子商务主要分为网购保税进口模式和直购进口模式两种。
(一)网购保税进口模式
企业提前将采购的国外商品保税进入海关特殊监管区域或保税物流中心(B型)存储，国内消费者在跨境电子商务网站订购商品，通过电子商务服务平台向海关进行申报。审核通过后，货物由特殊监管区域内的跨境电子商务仓库发出，消费者可方便快捷地购买国外商品。
与直购进口模式相比，保税进口模式下电子商务企业可以一次性从境外购入大批商品至特殊监管区域或B型保税物流中心，使单件商品国际物流成本大幅降低。另外，消费者下单后，商品直接从国内发货，可以比海外直购更早到达消费者手中。网购保税进口模式主要针对国内需求较大、销量可期、适合便于提前大规模采购并在国内备货的商品。对于部分小众化的商品，大规模的采购并提前国内仓储既不现实也不经济。
(二)直购进口模式
跨境电子商务直购进口模式是指国内个人购买者在跨境电子商务网站订购境外商品直接运输进境，按照海关的要求，通过电子商务服务平台和海关通关管理系统对订单、支付、运单等信息进行申报，并按照进境物品进口税率缴纳关税，实现快速通关。
在直购进口模式下，企业将货物储存在境外，消费者下单后将货物打包形成包裹运抵关境进行清关。与网购保税进口模式相比，直购进口模式无须企业在区内租赁仓库，无须提前在国内备货，消费者下单后才从境外打包运抵国内，省去了国内仓的租赁费用，企业经营成本降低了。
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