企业办理海关注册登记。注册登记指企业向主管部门申请许可，主管部门审查后准予或不准予许可。企业向海关提出注册书面申请；海关审核申请事项属于本海关职权范围，申请材料齐全、符合法定形式，受理申请；海关对企业申请进行审查，包括材料核实和现场核查；海关做出准予或者不予海关行政许可的决定，出具书面凭证；海关可依法办理注册登记的注销和撤销手续；企业应依法办理注册登记变更与延续手续。注册登记属于海关行政许可项目，由法律、行政法规、国务院决定设定，应当严格依照法定的权限、范围、条件、程序、形式和时限。
企业办理海关备案。备案指把企业情况报告给主管部门，主管部门审核通过后记录存档。企业向海关提交备案材料，提出备案申请；海关审核备案材料齐金、符合备案要求的，予以备案；海关可以对企业备案情况进行监督和实地检查、依法查阅或者要求报送有关材料；企业应按规定办理备案变更和注销，海关可依法注销企业备案。企业按流程提交符合要求的备案材料，通常就会审核通过备案成功，属于程序性操作，甚至可先由信息化系统自动审核备案，事后人工抽核备案材料，发现不符合要求的，要求企业补充备案材料，做进一步核实， 甚至实地检查。
企业办理海关信息登记。信息登记指把企业情况报告给主管部门，主管部门记录存档。企业向海关提交登记材料；海关审核登记材料齐全、符合要求的，予以登记。信息登记适用不需要报关资格的企业，主要为了记录企业主体信息，生成企业海关唯一编码标识，完成传输电子信息、主体标识、数据记录等操作，确保跨境电商通关数据完整。
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