巴西海关的特点有三个:效率低、流程繁琐、不透明。以下为巴西海关清关时需要注意的事项。
1.正本原件提单
巴西清关对于单证的要求是必须是正本原件提单，不接受电子单据。进口货的提单上必须写明海运费。如果出货代单(HBL)，出货代单的总海运费不得低于船东单(MBL)，否则整个箱子在目的港无法清关。运费高低无关轻重，值得注意的是巴西运费只能做预付(Prepaid)，不可以海运费到付。出货代单的必须是无船公共承运人(Non-vessel Operating Common Carrier, NVOCC)，而且在巴西海关注册备案过的才有效。
2.抽检
巴西海关对报关货物实行抽检的方式，即按照绿色、黄色、红色、灰色四种不同颜色分类处理。绿色即报关货物可全部免检并自动通关;黄色即仅检查报关文件，核实后，货物自动通关;红色即报关文件和货物均需经过检查后方能通关;灰色即除对文件和货物进行核查外，还需执行海关特殊监管程序，核实是否存在欺诈行为。根据规定，海关应在五个工作日之内提出验货结果，验货时当事人应在场，货物若需样检，所发生费用由当事人承担。如果货物不幸抽到红色通道报关，时间就会相对较长，一般需要十五天左右。
3. 免堆期和免费用箱期
免堆期(FreeTime Detention)指货物抵港后集装箱拖离码头外的免租期;免费用箱期(Free Time Demurrage)指货物抵港后集装箱在码头内的免租期。两个时间都可以向船公司申请，但为了不造成码头的拥堵，船公司一般只给七天的免费用箱期;免费用箱期可根据和船公司的关系去申请，最好可以拿到二十八天免费用箱期甚至更多天数。巴西的一般做法:货到港以后，客人会要求代理把柜子拖到码头外附近的Terminal去完成清关程序。这样可以充分利用免堆期。
4.进口许可证(Import License)
对于第一次做巴西业务或者不熟悉巴西市场的客人，最好先找到产品的海关编码，巴西称为NCMNO.。对照此编码查询此产品是否需要巴西海关要求提供的进口许可证，进口许可证分为自动进口许可证和非自动进口许可证两种。自动进口许可证的审批过程比较简单且自动批准;非自动许可证的申请及审批由巴西发展工商部外贸局负责，发放由各相关机构处理。进口商一般应在货物装船前向外贸局提出申请，进口许可证有效期为60天。货物到港后90天内进口商应办理报关手续，并将进口申报单输入巴西外贸网进行登记，开始报关程序;同时还需向海关提供装船单、商业发票、纳税单据及原产地证、商检证明和动物检验证明等文件。
海关收到上述文件后，对申报内容和货物进行核实，如完全一致，即通过巴西外贸网授权通关，此时进口商方可清关提货。如果不一致，那也没关
系，修改一次的费用为2800美元。
5.开船日期
货物开船日的时间以提单上的货物装船日期(ONBORAD DATE)为准，如果早于进口许可证申请下来的时间，比如开船日是2015年3月1日，但进口许可证申请下来的时间是2015年2月28日，货到港后，经巴西海关核实查出，目的港收货人需要支付1500美元左右的罚金。
