按照交易模式的不同，跨境电商可以分为 B2B、B2C、C2C、B2G等。
(1)企业与企业(Business to Business，B2B)之间的跨境电商，主要应用于企业之间的采购与讲出口贸易等。传统的电商形式中最常见的是 B2B 模式，核心在于交易双方都是商家。B2B可以分为三种模式:第一种是垂直模式，主要是整合某一专业领域的上下游产业链;第二种是综合模式，网站届于一个开发性的中间平台，如阿里巴巴、中国制造网等;第三种是自建平台模式，企业自己建立平台直接销售自有或采购的商品。
(2)企业与消费者(Business to Customer，B2C)之间的跨境电商，主要应用于企业直接销售或消费者全球购活动。随着大量第三方在线平台的建立，跨境电商的交易门槛大幅降低，越来越多的零售商甚至消费者直接参与在线购买和销售，从而缩短了供应链，减少了中间环节，甚至出现了不同国家或地区的消费者之间少量商品互通的C2C模式和生产厂家对消费者Manufacturers to Consumer,M2C模式。
(3)消费者与消费者(Customer to Customer，C2C)之间的跨境电商，主要应用于消费者之间的个人交易等行为。简而言之，C2C 是个人与个人之间的电商。C2C 模式的特点是大众化交易，早期的eBay 属于 C2C 平台，而一度非常流行的海淘代购模式也是典型的C2C。
(4)企业与政府(Business to Govement,B2G)之间通过网络所进行的交易活动的运作模式，是新近出现的电商模式，是企业与政府之间的跨境电商，主要应用于政府采购，但目前政府进行跨境采购要受到各国或地区诸多法规的限制。
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